谢邀。
从语法上分析的话，やめてくれ中用命令式的是くれる（给我），而やめろ中用命令式的就是やめる（停下）这个动词。
语意上都是命令对方停止，前者因为有一个くれる即动作由对方向我的指向性，所以相比后者，“因为你这个动作对我产生了不好的影响所以我命令你（给我）停下”的意思更多一点。
用户Hirotomo的说法不完全赞同。要恳求的话，谁敢用命令式？还不得乖乖地换成いただけますか（笑）。如果小学生揍乌龟这件事让你极为不快，如果对方停止会显著缓解这种不快的话，用第一种也没有什么问题。
语感这东西要慢慢琢磨。希望有帮助。
