哈萨克自治州并非正儿八经的副省级单位，其争议很大，理由如下：
1、
没有任何文件明确伊犁州为副省级州。
2、在国家的15个
和计划单列市中并没有
。根据1994年2月25日，
的发文（中编〔1994〕1号）。（副省级单位含
、10个副省级省会城市（沈阳市、长春市、
、南京市、杭州市、
、武汉市、广州市、
、西安市）、5个计划单列市（
、宁波市、厦门市、青岛市、深圳市，厦门市和深圳市还是经济特区）及浦东、滨海、两江三个
）。 国家在正式文件中提到副省级单位的时候，也从来没有提到过伊犁州。
3、所有副省级及以上干部都是中管干部，由中央任免，
州四套班子一把手并非为中管干部，也非由中央任免，而是自治区任免（主要指书记和州长，人大主任和政协主席是选举的）。另外，其州党委书记并非自治区党委常委兼任，甚至连其他三套班子的其他副职兼职都没有（当然，这一点说服力还不太强，仅仅是为了佐证一下而已，因为全国其他副省级地区的党委书记全都是党委常委兼任）。
4、由于副省级级别不明确，
州领导的级别也存在特殊和混乱的情况。比如说州人大、政协的正职为正厅级，州党委常委、人大副职、政府副职、政协副职基本为副厅级，但偶尔也有个别常委和其他班子副职被明确为正厅级的。如果伊犁州是副省级单位，其四套班子的副职必定为正厅级无疑。
5、自治区在任命
州的书记和州长时，从未明确他们的级别为副省级，因为自治区没这个权力。那么就意味着，他们并不是名正言顺的副部（省）级级别。
6、
州所直辖县市均为县处级，并非副厅级，只是个别县市的书记会高配为副厅级。
7、说是地级，但在
州干部任命除了州上四套班子领导外，其他部门和单位也的确全部是按副省级序列建制的，它的各部委办局都是副厅级建制，这点在自治区是给予明确的，从每次自治区任命伊犁州干部时可以看出。
8、1953年12月，经政务院批准准备成立
哈萨克自治区，辖伊犁、
、阿山3个专区，属新疆省人民政府领导，行政地位相当于当时的行署一级。
9、在军事上更是明显，
州从未享受管辖其他地区军事机关的权力。伊犁
执行军分区一级的职责权限，并未执行省军区的职责权限，即兵役动员、预备役编组、民兵工作等。伊犁军分区和其他地州市军分区平级，均为正师级单位，隶属新疆军区管辖。
10、在行政权力运用上又有所区别，比如州人民法院是作为
2个分院之一存在（
哈萨克自治州、兵团），并非其他地州市的中院。
人民检察院下辖
分院和
分院。
11、
州是全国唯一的既管地区、又管县市的自治州，由于同级辖同级在行政上无法操作，于是就出现了我国现行行政管理中的一个特例，
实际获得一个行政级别为地区级但享受副省级待遇的行政区划，处境仍然尴尬。隶属关系的特殊性，表现在受自治区人民政府委托，
与博尔塔拉蒙古自治州之间从1954年11月至1979年9月，曾经名义上存在着25年的代管关系。
12、另外补充一点，关于百度百科和维基百科上的内容的权威度：很多人误以为这两个网站上的内容就是权威，其实，要是完全了解这两个网站你就知道，他们的内容都是网友们提供和编辑的，并不是来自权威部门给出的权威答案，因此，这两个网站的内容并不是权威来源，也就不能当成权威来看待。当然，这两个网站提供的内容大多是真实可信的这一点也毋庸置疑，但存在不少谬误的地方也是客观事实。因此，以后不必完全奉这两个网站的内容为真理和权威。
如果伊犁州是正经八百的副省级州，就不会有上述争议了。
所以，伊犁州肯定不是国家承认的副省级州，但她在很多地方确实有副省级州的特点。就这样。
