回文结构指一段序列从左往右读和从右往左读内容相同，例如：
上海自来水来自海上。
山口山。
对于核酸序列来讲，要同时看双链，即正链从5'到3'读和负链从5'到3'读得到序列相同。
例如：
5‘-GGATCCAAGCTTGGATCC-3'
3'-CCTAGGTTCGAACCTAGG-5'
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对于这种回文的RNA双链，当我们去掉它的一条链后，剩下的那一条链的5'端可以和自己的3'端配对：
5‘-GGATCCAAG
3'-CCTAGG TTC
这就是一个典型的发卡结构。
但是发卡结构并不严格要求整段RNA序列均为回文结构。发卡结构只要求一段RNA序列的两端为回文结构，即在左右相互匹配的两段序列间允许有一些别的序列。如：
5‘-GGATCCAAG NNNNN CTTGGATCC-3'
综上所述，发卡结构包含，但可以不全是回文序列。
