“致两千年后的你”明显指的是三笠，而非艾伦，艾伦只是工具人。
“来自2000年的你”指的是始祖尤弥尔，这个是毫无争议的。
根据《进击的巨人》最终篇后篇，当三笠抱着艾伦的头一步一步走着的时候，始祖尤弥尔出现在她的面前。
而三笠对她说，一直以来在自己脑海里窥视的是她。
由此可以得出，“两千年后的你”指的正是三笠，因为始祖尤弥尔将三笠看成了两千年后的她本人，要看三笠面对三笠的弗里兹王、也就是艾伦会做怎样的选择。
在始祖尤弥尔看来，三笠对应的是她，艾伦对应的是初代弗里兹王。
她想要的答案，是三笠遵从自己的内心，选择终结艾伦而不是一股脑儿地追随艾伦，由此化解她长达两千年的怨念和心结。
如果致两千年后的你指的是艾伦，那么再路里艾伦和吉克争夺始祖巨人之力控制权的时候，她选择帮助艾伦的那一刻后，就应该彻底释然了，而不是一直等到天地之战结束，面对着砍下艾伦头的三笠，才心满意足的离开。
整个《进击的巨人》的故事，很大可能是始祖尤弥尔一手策划的，目的就是为了将三笠代入到她的视角或者立场，做一次与两千年前的她做出的不同的选择。
而艾伦，在一定程度上，是始祖尤弥尔经过两千年精心挑选出来的，一个在她看来最接近初代弗里兹王角色的一个彻头彻尾、彻彻底底的测试工具。
也可以这么说，不正常的始祖尤弥尔想看一出戏，然后牺牲了艾伦的人生，牺牲了三笠的爱情，目的只是为了她一个人的心理平衡……
