这个问题很简单，处死君主是革命的做法，流放君主是各方妥协的产物。况且拿破仑拥有法理，此外姑且算是主动退位，没有道理把他处死。相比较路易十六，十六是被宣布叛国罪之后被干的。虽然革命之野蛮让欧陆哗然，但倒也是合法的事情。
至于说拿破仑手上还有军队的，大概都是1814年闪电之周都不知道的存在，也不清楚恐怖的俄罗斯到底有多恐怖。
========================3月17日更新=========================
以上是简要的说明。
为什么反法同盟不杀了拿破仑，这要涉及到1814年枫丹白露条约的签订：
众所周知，1813年德意志解放战争之后，联军攻入法兰西本土，就此1814年法兰西战役拉开帷幕。尽管拿破仑曾打出闪电一周，也就是一周之内连战连胜，大挫联军（尤其是普鲁士人），然而仍阻挡不了物量差占据上风的同盟方攻入巴黎。另一方面，法国军界、政界反战呼声日益高涨。最终，4月6日，拿破仑在逼宫的诸元帅面前，于退位条款上署名，这也就是枫丹白露条约；同时签字表明生效的人物还有：科兰古（法外交部长）、麦克唐纳元帅、奈伊元帅、梅特涅亲王、哈登堡男爵（普鲁士宰相）、以及俄方的一位代表。该条约宣布拿破仑放弃对法国的主权，但仍保留皇帝称号，享有对厄尔巴岛的主权。
也就是说，枫丹白露条约，是同盟与拿破仑政权作出的妥协。并不是说所谓“区区几个国王能够动得了的问题”，因为现在生杀大权的确掌握在同盟手上。条约是通过外交博弈而最终得出的结果。最大的原因是，拿破仑拥有法理，而且拿破仑自愿退位，你也就没有道理去杀他；同时，拿破仑自己宣布退位，这等于放弃抵抗，放弃抵抗意味着武装冲突相应就会少很多，法国的局势相对来说也就容易控制，各国的军费也就不用燃烧，相反的情况，我不用说大家也都知道；倘若你不顾一切先杀拿破仑为敬，结果和拿破仑入侵西班牙赶跑西班牙国王是一样的，只能激起民愤，法国万一又诞生出一个极端政权又怎么办——同盟又不傻。
总结一下，同盟之所以不杀拿破仑，一、出于国际政治的考虑，二、拿破仑拥有合法性，以及拿破仑政权与同盟方谈判达成一致，并且签署了条约。
至于不审判，我只能说当时没有如今系统的国际法可以遵循。
顺便一提，同盟四大成员国，奥地利 俄罗斯 普鲁士 联合王国，其中只有后两者的君主头衔是国王，奥地利已经由大公国（或者说王公国）升格成帝国，相应的君主头衔也变更为皇帝；至于俄罗斯，沙皇，大家众所周知，况且他一个东正教徒为何要去鸟一个天主教教宗？
所以以下的这段文字就显得分外搞笑：
沙皇看到黑体字笑了，“教宗是啥？”
还有关于欧洲有不杀君主的传统，这个论调，倘若查理一世泉下有知估计得笑的从地里爬出来坟头蹦迪了。
再补充一条，利物浦伯爵是支持Castlereagh、Wellington的保拿设想的。
