党化教育得罪清华师生
身为国民党人，罗家伦执掌清华，并非希望学生成为自己当初在五四运动中所扮演，服膺自由主义的“新青年”，而是甘为三民主义的思想信徒的“革命党人”，政治过硬，业务突出，体格强健，立身谨严。罗家伦希望，这批精英能够帮助南京政府对内“打倒军阀”，对外“废除不平等条约”，实现“整个民族复兴”。为此，他在清华实施党化教育推崇三民主义的意识形态，并独尊一家。在清华内部，他发展国民党的党团组织，严厉制裁共产主义，国家主义信徒及组织，并时常邀请党国大员到校讲演。
除此以外，罗家伦强调纪律化，为党化教育服务。每周除了操场训练，野外演习外，还有军事训练。日常生活，也效仿军营，把全校分为四个队，每个队有队长，上面设有大队长。队长与学生一起生活，早晚点名，按时休息。时间安排为：六点三十分，起床；七点，早餐；十二点十五分，午餐；六点三十分，晚餐，十点三十分，熄灯。男生敬礼起居休假，都有一定规则，平时一律穿制服。
这种做法，实际是将政治机关的秩序与学术机构的秩序向混同，用政治秩序统驭学术秩序。罗家伦的军事化管理，导致民怨沸腾。
1930年10月，罗家伦上书教育部，要求教育部整顿清华。据在致陈布雷函中，罗对于继任清华校长人选，提出了三点注意事项：一，必须忠实于本党之同志，因学生所要求者，均系反党及于党无关之人，则对彼等之反动言行之滋长传播，更为便利； 离中央所在地愈远之大学，校长愈须择忠于党及忠于中央者，万万不可放松或徇情； 二，宁缺毋滥，不可过急，宁宽假时日，但必须择‘拿得出’的人，然后任命，此亦与中央威信有关也。三，清华于校风经过一度败坏后，必须择一较风厉干练，能实地奉行中央政令之人。他还上书蒋介石，表露其党化教育的基本理念。
但是，学术创造和科学研究，首先要求的是学术自由。身兼政学两届的罗家伦，更注重用“政”来统驭“学”，两者之间的内在矛盾，使其教育实践难以两全。罗家伦党化教育的成功所付出的代价，就是无情扼杀了大学作为学术机构的创造力。在师资力量，经费和等条件均不逊于西南联大的情况下，实施党化教育的中央大学，所取得的成就远远不能与学术自由的西南联大相比。而他将中央大学建设成世界一流大学的心愿，最终只能落空。
