第一次有人邀请回答，谢邀！
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具体铁六院成立的高层背景确实不清楚，只能从目前比较低的角度来简单说下个人的看法。基本上认为行政理由才是主要原因。
最早来说1234的分工和分类是以地域划分的，具有一定的时代背景，而且部里直管，相互之间虽然有竞争，但是也是体系内部的，计划经济下四家各自有自己的市场和设计环境，结果实际上四家的技术实力和长处也有较大差异，都是多年积累的结果，以铁一来说，高原冻土是多年积累的方向，青藏线的冻土技术不能说只是现在这一代人的独创，应该是三代人的积累才捧出了一个院士，这一点确实是核心竞争力。
以上废话只是简单介绍下背景。总结来说，四个院的历史和积累是很重要的财富和储备。
然后在06年改制的时候四家设计院脱离铁道部直管，分别划归中国中铁和中国铁建，其中1、4归中铁建，2、3归中国中铁，在铁路设计体系里面就有了比较均衡的竞争局面。
需要再着重说明的是，国内铁路设计招标采用的基本是两家设计院进行面对面的方案竞选，且仅有两家，每一次的选择两家基本也是尽量保证一家是传统地区势力范围的+分属另一家公司的一家进行竞选，铁道部在这个过程中并不是完全的以技术作为唯一选择条件，而是尽量维持平衡，否则基本上一多半都是2v4了，每次竞选中基本上也都是1、3比较陪标。然后再根据省界把项目拆分给参与竞标的两家，都有肉吃。这种规则实际上维护了中国中铁和中国铁建在设计市场的平衡。
然而自从铁道部一纸命令，铁三院由中国中铁划归铁道部直管，平衡就被打破了。1+4vs2，又不能铁二院一家每次代表中国中铁出战，这样就违背了平衡的原则，然后才有了铁五院，然而扶不上墙就是扶不上墙，，是否是出于数量取代质量，才有增加了铁六，就不好说了。
诚恳地说，只见过1、2、3、4之间的人员流动，或者是向5、6流动，很少见5、6反向流动回来，待遇上不好评价，但是技术上确实5、6无足可取，如果一个年轻人想要进入铁路设计这么冷门的行业，从技术起步的话，1-4才是你最好的选择，培训机制和技术力量能给你很好的开展，如果进入5、6你身边的导师同事都是行业三流，你又怎么能打好基础？
如果志在仕途，随便选吧，国企都一样
